Python の boto3 で S3 とダウンロード/アップロードする
https://sig9.org/archives/3005

PythonでBoto3を用いてAmazon S3バケットからファイルをダウンロードする
https://laboratory.kazuuu.net/downloading-files-from-amazon-s3-bucket-using-boto3-in-python/

AWS LambdaのPythonでS3のファイルを取得する
https://dev.classmethod.jp/articles/get-s3-object-with-python-in-lambda/

★AWS Batch および Amazon SageMaker を使用してオンラインの化合物溶解度予測ワークフローを構築する
https://aws.amazon.com/jp/blogs/news/build-an-online-compound-solubility-prediction-workflow-with-aws-batch-and-amazon-sagemaker/
Docker をインストールしてamazonlinuxを使い、

docker pull amazonlinux:latest

docker run -it amazonlinux:latest
yum install epel-release aws-cli python-pip
pip install boto3

boto3をインストール

yum install python2-rdkit
もインストール